对拉伸分子动力学模拟中拉伸方向优化的方法及装置 

本发明提供一种通过对拉伸分子动力学中拉伸方向进行优化的方法,对我们分析配体与受体间的相互作用、配体诱导蛋白质的构象变化、配体和受体的选择性结合与最优结合路径的判定,都提供了支持。首先,初始选取的拉伸方向做判断,只有当拉力达到一定的阈值时,开始对方向进行优化;然后,根据...
中国科学院上海药物研究所;大连理工大学  中国专利  2008年 下载次数(0)| 被引次数(0)

一种基于分子动力学的金刚石涂层膜基界面结合强度测量方法 

本发明公开了一种基于分子动力学的金刚石涂层膜基界面结合强度测量方法,该方法主要特点在于:借助分子动力学理论和仿真计算软件建立硬质合金基底金刚石涂层膜基界面模型并对膜基界面的力学性能进行仿真计算,基于仿真结果建立硬质合金基底金刚石涂层膜基界面结合强度预测模型,并通过该预测模型精确测量金刚石涂层膜基...
同济大学  中国专利  2014年 下载次数(0)| 被引次数(0)

一种基于分子动力学模拟筛分黄酮类化合物抗雄活性方法 

本发明公开了一种基于分子动力学模拟筛分黄酮类化合物抗雄活性方法,受试黄酮化合物结构经过优化后和同源模建获得的受体文件进行对接组成复合物,然后用GROMACS软件包进行分子动力学模拟20纳秒,计算黄酮化合物受体的12号螺旋8~20ns均方根偏差,将数据导入R语言包,计算出的标准偏差及残差建立区分模...
南京大学  中国专利  2017年 下载次数(0)| 被引次数(0)

神经调节蛋白突变体、筛选方法及应用 

本发明提供了筛选特异性激活ErbB受体的NRG突变体的方法,该方法包括:用同源模建方法建立NRG、ErbB3、ErbB4、NRG/ErbB3和NRG/ErbB4复合物的三维结构;分子动力学模拟NRG/ErbB3和NRG/ErbB4在溶液中的构象和稳定性;MM/PBSA方法计算N...
上海泽生科技开发有限公司  中国专利  2006年 下载次数(2)| 被引次数(0)