基于Gay-Berne势能模型的粗粒化分子动力学模拟研究有机分子体系的各向异性相态 

粗粒化分子动力学模拟由于在计算效率和模拟尺度上的优势,已成为分子模拟研究各种有机分子体系的有力工具。特别是在模拟生物大分子体系时,相对全原子的分子动力学和量子力学,其计算的速度优势尤为明显。然而,研究者开发的粗粒化模型往往只能针对特定的体系,具有一定的局限性。因此,对目前已有的较为通用的粗粒化势能模型的推广和改进是件很...
北京化工大学  硕士论文  2012年 下载次数(333)| 被引次数(1)

聚合过程中初生分子链结晶过程的非平衡态分子动力学模拟 

我们运用非平衡态分子动力学方法,研究了聚合初期生长着的分子链在催化剂表面凝聚行为的细节。我们发现,该分子链经历了一个初生态结晶过程。它包含着两个阶段:成核阶段与晶体生长阶段。由于表面的吸附,该链成核的长度比没有表面吸附的分子链来得短。
第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集  2011-08-05 下载次数(44)| 被引次数(0)

活性分子与多巴胺受体复合蛋白结构及其相互作用研究 

多巴胺受体多样性与脑区分布差异性导致功能差异,形成了脑内复杂的多巴胺神经系统,该系统发挥各种功能作用,参与调控运动、情感和认知活动过程,与药物成瘾性,精神分裂症和帕金森等密切相关。多巴胺受体发挥不同功能作用的基础是各亚型多巴胺受体蛋白的结构差异。以编号为3PBL的蛋白晶体结构是人体多巴胺第三受体(D3R)和依替必利分子...
云南大学  硕士论文  2017年 下载次数(55)| 被引次数()

聚合物表、界面结构及动力学演化的分子动力学模拟研究 

在高分子物理领域里,一个基本且重要的研究课题是关于聚合物在表、界面处的结构和动力学。吸附在固体表面的高分子链构象和动力学性质与其在本体中有很大差别。表面粘附、聚合物流体在狭窄几何容器内的流动都是这个课题在实际中的重要应用。实验上可以将链长统一的聚合物链吸附于表面,从而得到结构规整有序的自组装薄膜。进一步利用具有共轭电子...
吉林大学  博士论文  2011年 下载次数(1225)| 被引次数(3)

木质素缓释肥料的制备及相关分子模拟研究 

随着农业技术的快速发展,缓释肥料的使用越来越广泛。然而,目前农业上所施用的肥料,真正能够被农作物所吸收利用的较少,绝大部分都因自身及外界因素影响而导致流失。这既降低了肥料的利用率,同时也给环境带来了比较严重的污染。因此,如何提高肥料在农业上的利用率是国内外亟待解决的一个重要问题。尽管目前市场上已经出现了不同厂家生产的木...
南京林业大学  硕士论文  2014年 下载次数(470)| 被引次数(2)

玻璃态高聚物银纹化的粗粒珠簧分子动力学模拟 

本文基于粗粒珠簧链模型的分子动力学方法,采用并行计算程序,模拟分析了玻璃态高聚物银纹化的破坏过程。 第一部分:建立聚合物周期单胞模型。在不同拉伸速率下,模拟计算玻璃态高聚物银纹化的破坏过程。分析微空洞产生、银纹扩展及断裂过程和位置分布,考虑应变率相关的临界应力,引入银纹萌生判据验证,得到微空洞和集中应力产生可作为...
南京航空航天大学  硕士论文  2010年 下载次数(166)| 被引次数(1)

离子液体[Bmim]Cl在水中PMF的分子动力学模拟 

离子液体是一种仅由阴阳离子构成,室温下仍为液态的新型有机溶剂,因为其几乎不挥发,被视为“绿色溶剂”。近年来,其独特的性质引起了世界各国学者的广泛关注,尤其是在化学工程领域,被认为有望在诸多化工过程中取代传统的挥发性有机溶剂,为改善日益恶化的环境做出贡献。更重要的是,可以通过改变阴阳离子的组合方式根据需要设计其性质。但在...
北京化工大学  硕士论文  2011年 下载次数(640)| 被引次数(2)

壳聚糖改性聚天冬氨酸聚合物的制备及其阻垢缓蚀机理研究 

水污染与水资源短缺已成为人类社会和经济发展的制约因素,研究节能环保的环境治理技术势在必行。目前工业循环冷却水系统中大多使用的是以有机膦酸盐为主要成分的磷系药剂,磷系药剂是水中细菌和藻类的营养成分,含磷系药剂的循环冷却水排放后,易引起水体的富营养化,造成生态环境的破坏,因此,开发一种无磷环保型的阻垢缓蚀剂已成为水处理剂领...
武汉理工大学  博士论文  2018年 下载次数(193)| 被引次数(1)

螺旋高分子链拉伸不稳定性的分子动力学模拟 

我们采用分子动力学模拟的方法研究了螺旋高分子链在应力下的弹性行为,在模拟中运用了粗粒化的bead-spring模型来表征高分子链,为了产生螺旋构型,采用了Z.Guo和D.Thirumalai构造的粗粒化的螺旋二面角势。首先我们在高分子链的末端施加反方向的拉力,发现随着外加拉力的不断增加,高分子链的末端距会经历不连...
2013年全国高分子学术论文报告会论文摘要集——主题B:…  2013-10-12 下载次数(26)| 被引次数(0)

聚氨酯及丙烯酸酯胶黏剂体系与小分子相容性的分子动力学模拟研究 

胶粘剂体系均是多组分体系,组分间的相容性研究是进行配方设计、相态结构控制、增韧和粘附等性能能调整的重要手段。相容性研究一般是通过多组分体系的形貌学测量、热学参数、外观和热力学参数进行判断,研究过程复杂,影响因素多,研究结果重复性差,因此探索使用分子动力学方法研究相容性,不仅具有重要的学术意义也具有实用价值。丙烯酸酯-环...
北京化工大学  硕士论文  2014年 下载次数(503)| 被引次数(2)

葡甘聚糖微结构的分子动力学模拟 

本文以葡甘聚糖为试材,运用分子模拟同仪器分析相结合的手段,预测了葡甘聚糖分子链的高级结构,分析了无机分子对其结构、性能的影响,探讨了葡甘聚糖与卡拉胶微观作用机理。主要研究内容与结果如下: 1.葡甘聚糖单链高级结构的预测 利用Hyperchem7.0、VM2.0...
福建农林大学  硕士论文  2006年 下载次数(643)| 被引次数(18)

基于分子动力学模拟的两种重要蛋白结构与功能研究 

分子动力学模拟是一种能够揭示生物大分子结构与功能物质基础的重要方法。运用分子动力学模拟的方法,我们可以提供以时间为顺序单个粒子运动的最终细节。因此,利用此种方法构建模型来研究某个体系的具体性能问题,往往比实际实验来的容易。 本论文分别通过两个实例来展示分子动力学模拟应用于生物大分子研究中的直观优势。首先是对耐热...
上海交通大学  博士论文  2012年 下载次数(1525)| 被引次数(5)

奇碳链系列烷基苯磺酸盐分子动力学模拟 

本文利用分子动力学模拟方法分别考察不同浓度表面活性剂的聚集形态、烷基芳基磺酸盐界面性质以及系列烷基芳基磺酸盐的自由能微扰计算,主要内容如下: 1)用分子动力学的方法,模拟了十三烷基甲苯磺酸钠在不同浓度下油水体系的胶团形状,发现在临界胶团浓度以上,随浓度的增加,依次自发形成从球状胶团、棒状胶团、层状胶团到反胶束结构...
东北石油大学  硕士论文  2011年 下载次数(144)| 被引次数(1)

聚合过程中初生分子链结晶过程的非平衡态分子动力学模拟 

我们运用非平衡态分子动力学方法,研究了聚合初期生长着的分子链在催化剂表面凝聚行为的细节。我们发现,该分子链经历了一个初生态结晶过程。它包含着两个阶段:成核阶段与晶体生长
中国化学会第26届学术年会化学信息学与化学计量学分会场…  2008-07-01 下载次数(30)| 被引次数(0)

魔芋葡甘聚糖相互作用位点及微观结构的变化过程 

本论文以魔芋葡甘聚糖为材料,运用分子动力学模拟和现代仪器分析相结合的手段,初探了魔芋葡甘聚糖的相互作用位点,研究了魔芋葡甘聚糖与瓜尔豆胶、卡拉胶及与大豆分离蛋白相互作用的微观结构及其变化过程,并分析了其相互作用的机理。主要研究内容与结果如下: 1.魔芋葡甘聚糖与瓜尔豆胶相互作用的研究...
福建农林大学  硕士论文  2007年 下载次数(646)| 被引次数(11)

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